Основное направление клинического отдела - разработка современных концепций патогенетических аспектов кишечных инфекций и менингитов в Узбекистане с учетом климато-географических и экологических условий.
Заведующий отделом – д.м.н., проф. Бабаходжаев С.Н.
В 2011-2014 гг. в отделе выполняются 2 прикладных гранта.
Прикладной грант: «Усовершенствование диагностики и лечения пищевых токсикоинфекций и ботулизма и усовершенствование мер профилактики»
Руководитель проекта: к.м.н. Мухамедов И.Б.
Прикладной грант: «Усовершенствование новых технологий диагностики и лечения различных клинических форм менингитов в условиях Узбекистана».
Руководитель проекта: д.м.н., проф. Бабаходжаев С.Н.